Authors: Qiu Y, Zhuang Z, Meng F, Ruan D, Xu C, Ma F, Peng L, Ding R, Cai G, Yang M, Wu Z, Yang J, Zheng E
(Contact: jieyang2012@hotmail.com ) Affiliation: College of Animal Science and National Engineering Research Center for Breeding Swine Industry, South China Agricultural University, Guangzhou 510642, PR China Title: Identification of candidate genes associated with carcass component weights in commercial crossbred pigs through a combined GWAS approach Journal: Journal Of Animal Science, 101:skad121 (2023)
DOI :
10.1093/jas/skad121 Links:
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Number of QTL/association reported by traits:
QTL for Shoulder weight, Boston
Chr.1 : Asso:351049 , Asso:351050 , Asso:351051 , Asso:351064 , Asso:351080 , Asso:351081 , Asso:351082 . Chr.2 : Asso:351052 , Asso:351053 , Asso:351065 , Asso:351066 , Asso:351076 , Asso:351083 . Chr.4 : Asso:351054 , Asso:351067 , Asso:351077 , Asso:351084 . Chr.6 : Asso:351085 . Chr.7 : Asso:351055 , Asso:351068 , Asso:351086 . Chr.8 : Asso:350848 , Asso:351078 . Chr.9 : Asso:351056 , Asso:351057 , Asso:351058 , Asso:351069 , Asso:351070 , Asso:351071 , Asso:351087 , Asso:351088 . Chr.10 : Asso:350849 , Asso:351059 . Chr.12 : Asso:351060 , Asso:351061 , Asso:351072 , Asso:351073 . Chr.14 : Asso:351062 , Asso:351074 . Chr.15 : Asso:351063 , Asso:351075 . Chr.16 : Asso:351079 . Chr.17 : Asso:351089 .
QTL for Shoulder weight, picnic
Chr.1 : Asso:351004 , Asso:351017 , Asso:351036 . Chr.2 : Asso:351037 . Chr.3 : Asso:351005 , Asso:351006 , Asso:351007 , Asso:351018 , Asso:351019 , Asso:351020 , Asso:351029 , Asso:351030 , Asso:351038 . Chr.4 : Asso:351021 . Chr.5 : Asso:351008 , Asso:351022 , Asso:351023 , Asso:351039 , Asso:351040 , Asso:351041 . Chr.6 : Asso:350850 , Asso:351009 , Asso:351010 , Asso:351011 , Asso:351012 , Asso:351013 , Asso:351024 , Asso:351025 , Asso:351031 , Asso:351032 , Asso:351033 , Asso:351042 , Asso:351043 , Asso:351044 . Chr.7 : Asso:351034 , Asso:351045 . Chr.8 : Asso:351046 . Chr.9 : Asso:351014 , Asso:351026 . Chr.10 : Asso:351047 . Chr.12 : Asso:350851 , Asso:351015 , Asso:351027 , Asso:351035 . Chr.15 : Asso:351016 , Asso:351028 , Asso:351048 .
QTL for Shoulder external fat weight
Chr.1 : Asso:350925 , Asso:350937 . Chr.3 : Asso:350938 , Asso:350955 . Chr.4 : Asso:350956 , Asso:350957 , Asso:350958 . Chr.6 : Asso:350926 , Asso:350927 , Asso:350939 , Asso:350940 , Asso:350949 . Chr.7 : Asso:350852 , Asso:350928 , Asso:350941 , Asso:350950 , Asso:350959 . Chr.8 : Asso:350929 . Chr.10 : Asso:350930 , Asso:350942 , Asso:350951 , Asso:350960 . Chr.11 : Asso:350931 , Asso:350932 , Asso:350943 , Asso:350944 , Asso:350952 . Chr.12 : Asso:350961 . Chr.13 : Asso:350933 , Asso:350934 , Asso:350945 , Asso:350946 , Asso:350953 . Chr.14 : Asso:350962 . Chr.15 : Asso:350954 . Chr.16 : Asso:350935 , Asso:350947 , Asso:350963 , Asso:350964 . Chr.17 : Asso:350936 , Asso:350948 , Asso:350965 . Chr.18 : Asso:350966 .
QTL for Belly weight
Chr.2 : Asso:350853 , Asso:350875 , Asso:350888 , Asso:350895 , Asso:350896 . Chr.3 : Asso:350876 . Chr.5 : Asso:350877 . Chr.6 : Asso:350867 , Asso:350868 , Asso:350878 , Asso:350897 . Chr.7 : Asso:350869 , Asso:350870 , Asso:350879 , Asso:350880 , Asso:350889 , Asso:350890 , Asso:350898 , Asso:350899 . Chr.8 : Asso:350881 , Asso:350900 , Asso:350901 . Chr.9 : Asso:350871 , Asso:350882 , Asso:350891 , Asso:350902 . Chr.10 : Asso:350883 , Asso:350892 , Asso:350903 . Chr.12 : Asso:350872 . Chr.13 : Asso:350884 . Chr.14 : Asso:350873 , Asso:350885 , Asso:350893 . Chr.15 : Asso:350874 , Asso:350886 , Asso:350887 , Asso:350894 , Asso:350904 .
QTL for Loin weight
Chr.1 : Asso:350854 , Asso:350916 . Chr.2 : Asso:350905 , Asso:350912 , Asso:350917 . Chr.4 : Asso:350906 , Asso:350909 , Asso:350913 , Asso:350918 , Asso:350919 . Chr.5 : Asso:350920 . Chr.6 : Asso:350921 . Chr.7 : Asso:350914 , Asso:350922 . Chr.10 : Asso:350923 . Chr.13 : Asso:350907 , Asso:350910 . Chr.15 : Asso:350855 , Asso:350856 , Asso:350857 , Asso:350858 , Asso:350859 , Asso:350908 , Asso:350911 , Asso:350915 , Asso:350924 .
QTL for Hind leg weight
Chr.1 : Asso:350860 . Chr.2 : Asso:350967 , Asso:350975 , Asso:350990 . Chr.3 : Asso:350861 , Asso:350862 , Asso:350863 , Asso:350968 , Asso:350976 , Asso:350987 , Asso:350991 . Chr.4 : Asso:350977 , Asso:350992 . Chr.5 : Asso:350993 , Asso:350994 . Chr.6 : Asso:350864 , Asso:350969 , Asso:350970 , Asso:350978 , Asso:350995 , Asso:350996 . Chr.7 : Asso:350971 , Asso:350979 , Asso:350997 . Chr.8 : Asso:350980 , Asso:350988 , Asso:350998 . Chr.9 : Asso:350972 , Asso:350981 . Chr.11 : Asso:350982 , Asso:350999 . Chr.12 : Asso:351000 . Chr.14 : Asso:350983 , Asso:351001 . Chr.15 : Asso:350984 , Asso:350985 . Chr.16 : Asso:351002 . Chr.17 : Asso:350973 , Asso:350986 . Chr.18 : Asso:350974 , Asso:350989 , Asso:351003 .
QTL for Hind leg external fat weight
Chr.1 : Asso:351090 , Asso:351091 . Chr.3 : Asso:350865 , Asso:351092 , Asso:351093 , Asso:351105 , Asso:351106 , Asso:351117 , Asso:351120 . Chr.4 : Asso:351094 , Asso:351095 , Asso:351107 , Asso:351108 , Asso:351121 , Asso:351122 . Chr.5 : Asso:351096 , Asso:351109 , Asso:351123 . Chr.6 : Asso:351124 , Asso:351125 . Chr.9 : Asso:351097 , Asso:351098 , Asso:351110 , Asso:351126 , Asso:351127 , Asso:351128 . Chr.10 : Asso:351099 , Asso:351111 , Asso:351129 . Chr.11 : Asso:350866 , Asso:351118 . Chr.12 : Asso:351100 , Asso:351130 . Chr.14 : Asso:351101 , Asso:351112 , Asso:351113 , Asso:351131 . Chr.15 : Asso:351102 , Asso:351114 , Asso:351119 , Asso:351132 , Asso:351133 . Chr.17 : Asso:351103 , Asso:351104 , Asso:351115 , Asso:351116 .
QTL/association Reported by chromosomes:
Chr.1 (17) ,
Chr.2 (18) ,
Chr.3 (26) ,
Chr.4 (21) ,
Chr.5 (13) ,
Chr.6 (33) ,
Chr.7 (23) ,
Chr.8 (10) ,
Chr.9 (22) ,
Chr.10 (14) ,
Chr.11 (9) ,
Chr.12 (13) ,
Chr.13 (8) ,
Chr.14 (12) ,
Chr.15 (27) ,
Chr.16 (6) ,
Chr.17 (10) ,
Chr.18 (4) .
Number of gene-based eQTL/associations:
Cite this Dataset :
Animal QTLdb: Dataset from Qiu Y, Zhuang Z, Meng F, Ruan D, Xu C, Ma F, Peng L, Ding R, Cai G, Yang M, Wu Z, Yang J, Zheng E (2023). Identification of candidate genes associated with carcass component weights in commercial crossbred pigs through a combined GWAS approach. Journal of animal science, 101:skad121;
Curated into QTLdb on 2026-07-23. Universal link to this data set:
https://www.animalgenome.org/QTLdb/supp/?t=GiAb5Z5ByS
OR
Qiu Y, Zhuang Z, Meng F, Ruan D, Xu C, Ma F, Peng L, Ding R, Cai G, Yang M, Wu Z, Yang J, Zheng E (2023). Identification of candidate genes associated with carcass component weights in commercial crossbred pigs through a combined GWAS approach. Journal of animal science, 101:skad121; DOI: https://dx.doi.org/ 10.1093/jas/skad121
